文献管理软件——Endnote,Mendeley和Readcute

随着文献阅读量的逐渐增加,电脑中堆积的文献也越来越多。平时习惯性的按照研究课题或者研究催化剂,将这些文献堆积在不同的文件夹中,比如,TiO2,HER,PdNi等等——文件夹少的时候还算好些,但是时间一多,问题就来了,翻找了很久也找不到所要的文献。
这时候有人可能会说,你可以使用Endnote啊。的确,Endnote是一款不错的文献管理软件,但是我感觉它更多的用来管理“引文”。事实上,当初的软件设计者设计Endnote时应当就是抱这这样管理“引文”的想法,并且在绝大多数情况下,人们也是这样子对待Endnote的。当我要写论文的时候,使用Endnote简单的插入一条引文很方便,在其他地方重复插入这条引文更是让人感觉到“赏心悦目”。如果很不幸的需要重新投稿,那么在Endnote中一键选择新的期刊模板,引文格式更是让人工作量大减。尽管如此,Endnote也是有自己的缺点的,那就是对于插入的PDF文件管理上不是很方便,而Endnote在文献笔记上的缺点,使得我感觉Endnote很难算作一款真正意义上的文献管理软件。虽然我们可以在每个条目下找到Note这一栏,但是它隐藏的如此之深,每次都需要拖动很久才能够翻到。而且支持的格式也相对较少。更为无奈的是,PDF显示在一个小窗口中,看起来的确有点吃力——当然这也是因为Endnote作为一款引文管理软件必须使得reference更加方便的被找到这个设计初衷所决定的。
后来有一次无意间看到有一款叫做Mendeley的文献管理软件,安装上之后真是感觉到这是一款真正意义上的文献管理软件,能够很方便的管理下载的PDF文件,内置PDF文件阅读器,做笔记,支持笔记和全文搜索;此外还支持在Word中插入引文。当然, Mendeley的缺点也是很明显的,就是周围用的人不多,能够对我的论文最终引文起决定作用的人不用,也就是说Mendeley这软件太小众了,每次只能够用来管理文献而已。不过我需要的就是这样子的文献管理软件,作为Endnote 的有力补充。
网上已经有很多Mendeley的介绍,大家首先可以去官网看下介绍:
http://www.mendeley.com/features/。
这里简单说下,首先Mendeley是一款免费的软件,支持多个系统。它能够自动导入本地文献,不用逐字输入,可以一键google scholar自动完成几乎所有信息,包括DOI,url。此外能够监视选定的文件夹,当有新的pdf文件添加进去的时候,它能够自动导入新的条目。更为重要的是,Mendeley支持tag。tag虽然看起来和文件夹类似,但是同一个文件可以拥有很多个tag用来关联,但是在一般情况下则仅仅能够放在一个文件夹。当然这里也必须提到Endnote的文件夹管理模式。在理想情况下,我们可以提前建立很多个文件夹用来将之后的导入的文献或者reference拖动到不同的文件夹,它也支持一条记录存放在不同的位置。但是前提是我们要规划好——对于日常生活而言,提前规划看起来还是比较正常的,或者说大体上还可以掌控的,但是对于科学研究而言,很多情况下,我们面对是未知的事物,这就要求我们要根据具体情况来分析。举个例子,对于多学科交叉,该怎么办?或者说一个更为现实的情况,对于新的领域,你总不能一下子就能够分类好吧?这个逐渐学习的过程通过使用tag就能够很好的解决。这里多说一句,对于OneNote和Evernote之争,很多人Evernote用户会提到Onenote不支持tag。tag对于大量的数据而言,是分类和迅速定位的关键,也是对于内容学习的深度概括。
Mendeley此外同时还提供PDF文件浏览、笔记和文字选择等功能。另外你所做的笔记和引文内容甚至还支持全文搜索。这样更容易从浩瀚的论文中找到你所需要的内容。Mendeley还有一个实用的功能就是文献同步与共享,这可以让你在不同的计算机和终端,以及在不同的地方都可以阅读文献,共享功能也可以让你轻松的开展团队协作。每个人貌似有1 GB的“随身”携带空间。
Mendeley还有一个优点就是提供了一个科研工作者的社区,在Mendeley Web上可以找到那些具有共同研究的人员,建立群组。并且还可以看到该领域内的论文,虽然不能获取原文,但是可以了解到研究领域中那些文献是经典的。
不过遗憾的是对中文文献支持较差,很多中文文献的信息抽取不出来,不过中文的文献数据库喜欢在文献中加入其他东西,信息的抽取自然会有问题。此外还有部分使用者去年反映当数据条面非常之多的时候(上万条),可能会出现软件启动经常卡死,反应慢的问题。不过随着时间的过去,我相信Mendeley会重新优化软件,解决这个问题。
另外一个Readcute的使用是件很有趣的事情。忘了是在什么时候下载Nature的论文的时候有文件格式选择的问题,其中一个就是“Enhance PDF”,后来在Weily数据库中也开始提供这种选择。这其实就是在ReadCube中出现的格式。话说这个软件启动是非常有当年Picasa启动的范儿。打开之后发现原来文献管理软件也可以做漂亮,真的是难为他们了。
输入搜索之后出现的下面的窗口,感觉其实就是一个客户端版的学术搜索引擎,不过支持下载和文献管理。也可以做笔记,不过不会出现分条目的情况,所有的Note都在一块。另外在文献页还能直接看到引用情况——也就是真正的Enhanced PDF。
不过这个软件最大的硬伤把所有的条目寄托在PDF文件上,也就是你不能够手动添加条目,必须要有PDF文件才可以。所以这个软件才刚刚起步,需要增强的的地方还很多。

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